金陵十二钗的故事与《红楼梦》主线故事情节紧密相连，其结局也被影响和塑造了。
其中，贾宝玉和林黛玉谁也没有能够幸免于难，贾宝玉在一次放血治病的时候突发病情而去世，林黛玉则在宝玉去世后病倒，最终不治身亡。而金陵十二钗的其他人物，则各自经历了不同的命运。
探春抛弃了婚姻，从此守贞不嫁，选择了回归宗教。湘云则为了替宝玉报仇，最终自杀而亡。妙玉则跟随探春一起回归宗教，继续修行。贾政、贾母、王夫人等人则继续过着自己的生活，但已经感受到了腐朽的末日。
整个结局显示出虚幻的人生和无奈的命运。《红楼梦》透过金陵十二钗的命运，揭示出封建社会的腐败和人性的扭曲，同时也强调了人生的无常和虚幻。最终，整个故事以悲剧收场，讽刺和警示了读者对现实生活中的价值观和道德观。